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SEO対策にはHTMLによる最適化も必要である。検索エンジンのアルゴリズムは、HTMLの「title」「meta」「strong」「hn」などの各要素などをかなり重視すると考えられているのでSEO対策をする場合には重要なキーワードをこのタグで囲い重要であると言うことを検索エンジンに示すと良いSEOである。例えば見出しとして強調するキーワードを大きな文字で表示するようにマークアップするとそれは単に「大きな文字」というようにしか解釈されないように思えてしまうが、「h1」要素やスタイルシートによる装飾を使えば、検索エンジンに対してそれが見出しであるとはっきりと解釈される事になる。それはすなわち検索にヒットしやすくなる事であり、これは、基礎的なSEO対策になっていると言える。なお、この手法は文書の論理構造を考えず頻繁に行うと検索エンジンは検索エンジンスパムとみなす場合がありSEO上も宜しくないので注意はして欲しいものである。
SEOというのは誤解の多い言葉です。単なるテクニックとして、キーワードをサイトのあちこちに埋め込んだり、外部からやみくもにリンクをもらったりしても、サーチエンジンに迷惑がられるのがオチ。結果、順位はなかなか上がらないし、順位だけ上がっても、訪問者が思うように増えるわけではないし、その訪問が購入に結びつくものにはなりません。SEOの「SE」とは、単にサーチエンジンのアルゴリズムを言うのではなく、サーチエンジンを使って探し物をしているユーザーの気持ちだということを忘れてはなりません。